Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRCC1Q9C099 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms