Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF2Q9C093 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms