Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BARHL1Q9BZE3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BARHL1Q9BZE3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms