Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSD3Q9BZ95 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms