Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IFT27Q9BW83 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
IFT27Q9BW83 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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