Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
MCMBPQ9BTE3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms