Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RHOXF2Q9BQY4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms