Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BPIFA3Q9BQP9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BPIFA3Q9BQP9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms