Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSRNP1Q96S65 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSRNP1Q96S65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms