Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85AQ96PX6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms