Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPNS2Q96L46 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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