Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SMIM12Q96EX1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SMIM12Q96EX1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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