Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NMD3Q96D46 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NMD3Q96D46 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms