Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SPTSSAQ969W0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SPTSSAQ969W0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SPTSSAQ969W0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SPTSSAQ969W0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SPTSSAQ969W0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPTSSAQ969W0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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