Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRF1Q92994 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms