Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PRG4Q92954 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms