Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DPF3Q92784 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms