Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RGP1Q92546 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RGP1Q92546 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms