Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF398Q8TD17 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF398Q8TD17 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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