Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BEST4Q8NFU0 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms