Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HJURPQ8NCD3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HJURPQ8NCD3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms