Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME9Q86XW9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME9Q86XW9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms