Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT27Q7Z3Y8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT27Q7Z3Y8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms