Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD4Q7Z3J3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms