Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
STRCQ7RTU9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms