Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms