Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTF1AQ7RTS3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTF1AQ7RTS3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms