Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP50Q70EL3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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