Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00299Q6ZSB3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms