Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM72Q6ZMU5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms