Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USPL1Q5W0Q7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms