Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLX4IPQ5VYV7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms