Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LRCH2Q5VUJ6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms