Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Q5VSD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms