Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOGA3Q5TF21 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms