Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NUP188Q5SRE5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NUP188Q5SRE5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms