Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AKAP4Q5JQC9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AKAP4Q5JQC9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms