Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TTLL9Q3SXZ7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms