Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC96Q2M329 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms