Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDKN3Q16667 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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