Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ECM1Q16610 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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ECM1Q16610 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ECM1Q16610 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
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