Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
GRIK4Q16099 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms