Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP6AP1Q15904 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms