Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HMGN3Q15651 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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