Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIV2LQ15477 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIV2LQ15477 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms