Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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COL19A1Q14993 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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COL19A1Q14993 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL19A1Q14993 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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COL19A1Q14993 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COL19A1Q14993 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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