Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SQLEQ14534 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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