Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRIM25Q14258 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms