Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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