Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CACNA1SQ13698 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CACNA1SQ13698 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms